Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BNIP1Q12981 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BNIP1Q12981 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNIP1Q12981 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNIP1Q12981 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
BNIP1Q12981 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNIP1Q12981 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNIP1Q12981 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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