Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
HMGXB3Q12766 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
HMGXB3Q12766 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
HMGXB3Q12766 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
HMGXB3Q12766 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
HMGXB3Q12766 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
HMGXB3Q12766 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
HMGXB3Q12766 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
HMGXB3Q12766 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
HMGXB3Q12766 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
HMGXB3Q12766 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC48.72■■■■■ 5.39
HMGXB3Q12766 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC48.71■■■■■ 5.39
HMGXB3Q12766 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
HMGXB3Q12766 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
HMGXB3Q12766 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
HMGXB3Q12766 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
HMGXB3Q12766 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
HMGXB3Q12766 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC48.63■■■■■ 5.38
HMGXB3Q12766 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC48.63■■■■■ 5.38
HMGXB3Q12766 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
HMGXB3Q12766 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC48.62■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC48.61■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC48.58■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC48.57■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC48.57■■■■■ 5.37
HMGXB3Q12766 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
HMGXB3Q12766 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
HMGXB3Q12766 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
HMGXB3Q12766 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.53■■■■■ 5.36
HMGXB3Q12766 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
HMGXB3Q12766 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC48.52■■■■■ 5.36
HMGXB3Q12766 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
HMGXB3Q12766 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC48.5■■■■■ 5.35
HMGXB3Q12766 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
HMGXB3Q12766 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC48.49■■■■■ 5.35
HMGXB3Q12766 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
HMGXB3Q12766 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
HMGXB3Q12766 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.44■■■■■ 5.34
HMGXB3Q12766 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
HMGXB3Q12766 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
HMGXB3Q12766 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
HMGXB3Q12766 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC48.4■■■■■ 5.34
HMGXB3Q12766 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
HMGXB3Q12766 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
HMGXB3Q12766 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
HMGXB3Q12766 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
HMGXB3Q12766 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC48.37■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC48.35■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC48.35■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC48.34■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC48.33■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
HMGXB3Q12766 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
HMGXB3Q12766 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC48.27■■■■■ 5.32
HMGXB3Q12766 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
HMGXB3Q12766 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
HMGXB3Q12766 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
HMGXB3Q12766 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
HMGXB3Q12766 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
HMGXB3Q12766 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
HMGXB3Q12766 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC48.18■■■■■ 5.3
HMGXB3Q12766 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.17■■■■■ 5.3
HMGXB3Q12766 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
HMGXB3Q12766 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
HMGXB3Q12766 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
HMGXB3Q12766 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
HMGXB3Q12766 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
HMGXB3Q12766 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.12■■■■■ 5.29
HMGXB3Q12766 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
HMGXB3Q12766 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
HMGXB3Q12766 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
HMGXB3Q12766 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
HMGXB3Q12766 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC48.09■■■■■ 5.29
HMGXB3Q12766 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
HMGXB3Q12766 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
HMGXB3Q12766 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
HMGXB3Q12766 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms