Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 SGA1YIL099W 1650 nt10.85□□□□□ -0.67
LSP1Q12230 VPS62YGR141W 1404 nt10.84□□□□□ -0.67
LSP1Q12230 YPS3YLR121C 1527 nt10.83□□□□□ -0.68
LSP1Q12230 UBX6YJL048C 1191 nt10.82□□□□□ -0.68
LSP1Q12230 QDR2YIL121W 1629 nt10.81□□□□□ -0.68
LSP1Q12230 DLD2YDL178W 1593 nt10.8□□□□□ -0.68
LSP1Q12230 UGA4YDL210W 1716 nt10.8□□□□□ -0.68
LSP1Q12230 MAE1YKL029C 2010 nt10.8□□□□□ -0.68
LSP1Q12230 SSN3YPL042C 1668 nt10.77□□□□□ -0.69
LSP1Q12230 YDL086WYDL086W 822 nt10.77□□□□□ -0.69
LSP1Q12230 SEC61YLR378C 1443 nt10.76□□□□□ -0.69
LSP1Q12230 TSC10YBR265W 963 nt10.75□□□□□ -0.69
LSP1Q12230 SDH5YOL071W 489 nt10.74□□□□□ -0.69
LSP1Q12230 YLR279WYLR279W 390 nt10.73□□□□□ -0.69
LSP1Q12230 GID8YMR135C 1368 nt10.73□□□□□ -0.69
LSP1Q12230 DIG1YPL049C 1359 nt10.73□□□□□ -0.69
LSP1Q12230 BNI5YNL166C 1347 nt10.72□□□□□ -0.69
LSP1Q12230 MSB4YOL112W 1479 nt10.7□□□□□ -0.7
LSP1Q12230 HEM13YDR044W 987 nt10.69□□□□□ -0.7
LSP1Q12230 YER188WYER188W 720 nt10.68□□□□□ -0.7
LSP1Q12230 YGR012WYGR012W 1182 nt10.68□□□□□ -0.7
LSP1Q12230 PSD1YNL169C 1503 nt10.68□□□□□ -0.7
LSP1Q12230 OXA1YER154W 1209 nt10.67□□□□□ -0.7
LSP1Q12230 MRS6YOR370C 1812 nt10.66□□□□□ -0.7
LSP1Q12230 ZAP1YJL056C 2643 nt10.66□□□□□ -0.7
LSP1Q12230 ACO2YJL200C 2370 nt10.66□□□□□ -0.7
LSP1Q12230 YKL133CYKL133C 1392 nt10.65□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 FUB1YCR076C 753 nt10.64□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 OSH7YHR001W 1314 nt10.63□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 DMA2YNL116W 1569 nt10.62□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 CYT1YOR065W 930 nt10.62□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 ODC1YPL134C 933 nt10.62□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 AIM1YAL046C 357 nt10.61□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 MSC1YML128C 1542 nt10.61□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 MET2YNL277W 1461 nt10.61□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 PHO23YNL097C 993 nt10.6□□□□□ -0.71
LSP1Q12230 RAS2YNL098C 969 nt10.58□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 FCY21YER060W 1587 nt10.57□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 NUC1YJL208C 990 nt10.57□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 TAT2YOL020W 1779 nt10.57□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 APT2YDR441C 546 nt10.56□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 SOL2YCR073W-A 948 nt10.55□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.55□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 YHR219WYHR219W 1875 nt10.55□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 CSM1YCR086W 573 nt10.54□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 YLR046CYLR046C 813 nt10.54□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 PRY1YJL079C 900 nt10.53□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 LSR1LSR1 1175 nt10.53□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 SSL2YIL143C 2532 nt10.52□□□□□ -0.72
LSP1Q12230 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 SMM1YNR015W 1155 nt10.49□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 SFP1YLR403W 2052 nt10.48□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 LSB5YCL034W 1065 nt10.47□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 DLD3YEL071W 1491 nt10.47□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 LSM5YER146W 282 nt10.46□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 TIM44YIL022W 1296 nt10.46□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 GPN2YOR262W 1044 nt10.46□□□□□ -0.73
LSP1Q12230 GND1YHR183W 1470 nt10.45□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 YDR455CYDR455C 309 nt10.45□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 RAD23YEL037C 1197 nt10.44□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 YHL008CYHL008C 1884 nt10.43□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 RPD3YNL330C 1302 nt10.43□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 YHR218WYHR218W 1812 nt10.43□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.43□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 MDM35YKL053C-A 261 nt10.43□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 ENT4YLL038C 744 nt10.43□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 ITR2YOL103W 1830 nt10.42□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 CAB5YDR196C 726 nt10.42□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 YLR111WYLR111W 333 nt10.42□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 TIP1YBR067C 633 nt10.42□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 HXT10YFL011W 1641 nt10.42□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 GID7YCL039W 2238 nt10.42□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 SAM3YPL274W 1764 nt10.42□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 OYE2YHR179W 1203 nt10.41□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 EAF3YPR023C 1206 nt10.41□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 NPP1YCR026C 2229 nt10.41□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 RPT5YOR117W 1305 nt10.4□□□□□ -0.74
LSP1Q12230 TPS1YBR126C 1488 nt10.38□□□□□ -0.75
LSP1Q12230 YJL055WYJL055W 738 nt10.38□□□□□ -0.75
LSP1Q12230 DDI1YER143W 1287 nt10.37□□□□□ -0.75
LSP1Q12230 LOT5YKL183W 921 nt10.37□□□□□ -0.75
LSP1Q12230 YJL118WYJL118W 660 nt10.36□□□□□ -0.75
LSP1Q12230 CWP2YKL096W-A 279 nt10.36□□□□□ -0.75
LSP1Q12230 ERG13YML126C 1476 nt10.36□□□□□ -0.75
LSP1Q12230 RIB3YDR487C 627 nt10.35□□□□□ -0.75
LSP1Q12230 VRG4YGL225W 1014 nt10.33□□□□□ -0.76
LSP1Q12230 VMA11YPL234C 495 nt10.33□□□□□ -0.76
LSP1Q12230 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.3□□□□□ -0.76
LSP1Q12230 YMR262WYMR262W 942 nt10.3□□□□□ -0.76
LSP1Q12230 GLR1YPL091W 1452 nt10.3□□□□□ -0.76
LSP1Q12230 SNX3YOR357C 489 nt10.28□□□□□ -0.76
LSP1Q12230 RPC31YNL151C 756 nt10.27□□□□□ -0.77
LSP1Q12230 SAC7YDR389W 1965 nt10.26□□□□□ -0.77
LSP1Q12230 AGP3YFL055W 1677 nt10.25□□□□□ -0.77
LSP1Q12230 TMA23YMR269W 636 nt10.25□□□□□ -0.77
LSP1Q12230 ELO1YJL196C 933 nt10.24□□□□□ -0.77
LSP1Q12230 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.24□□□□□ -0.77
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