Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 NSR1YGR159C 1245 nt23.4■■□□□ 1.34
LSP1Q12230 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.18■■□□□ 1.3
LSP1Q12230 NOP1YDL014W 984 nt22.24■■□□□ 1.15
LSP1Q12230 MDJ1YFL016C 1536 nt21.4■■□□□ 1.02
LSP1Q12230 YKL036CYKL036C 393 nt20.02■□□□□ 0.8
LSP1Q12230 YJL027CYJL027C 417 nt19.67■□□□□ 0.74
LSP1Q12230 SRX1YKL086W 384 nt19.41■□□□□ 0.7
LSP1Q12230 Q0297Q0297 156 nt19.25■□□□□ 0.67
LSP1Q12230 DBP2YNL112W 1641 nt18.64■□□□□ 0.57
LSP1Q12230 YCR051WYCR051W 669 nt18.47■□□□□ 0.55
LSP1Q12230 YBR190WYBR190W 312 nt18.31■□□□□ 0.52
LSP1Q12230 RTC3YHR087W 336 nt17.98■□□□□ 0.47
LSP1Q12230 SCS3YGL126W 1143 nt17.95■□□□□ 0.46
LSP1Q12230 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.88■□□□□ 0.45
LSP1Q12230 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.88■□□□□ 0.45
LSP1Q12230 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.88■□□□□ 0.45
LSP1Q12230 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.88■□□□□ 0.45
LSP1Q12230 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.88■□□□□ 0.45
LSP1Q12230 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.88■□□□□ 0.45
LSP1Q12230 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.88■□□□□ 0.45
LSP1Q12230 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.88■□□□□ 0.45
LSP1Q12230 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.88■□□□□ 0.45
LSP1Q12230 CCC1YLR220W 969 nt17.82■□□□□ 0.44
LSP1Q12230 RVS167YDR388W 1449 nt17.42■□□□□ 0.38
LSP1Q12230 YOL085CYOL085C 342 nt17.36■□□□□ 0.37
LSP1Q12230 RPP1BYDL130W 321 nt17.31■□□□□ 0.36
LSP1Q12230 PKP1YIL042C 1185 nt17.25■□□□□ 0.35
LSP1Q12230 SCJ1YMR214W 1134 nt17.25■□□□□ 0.35
LSP1Q12230 SSA3YBL075C 1950 nt17.22■□□□□ 0.35
LSP1Q12230 PUT4YOR348C 1884 nt17.05■□□□□ 0.32
LSP1Q12230 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.75■□□□□ 0.27
LSP1Q12230 SHR5YOL110W 714 nt16.67■□□□□ 0.26
LSP1Q12230 PET122YER153C 765 nt16.65■□□□□ 0.26
LSP1Q12230 URN1YPR152C 1398 nt16.59■□□□□ 0.25
LSP1Q12230 ARE1YCR048W 1833 nt16.59■□□□□ 0.25
LSP1Q12230 POA1YBR022W 534 nt16.54■□□□□ 0.24
LSP1Q12230 SAH1YER043C 1350 nt16.51■□□□□ 0.23
LSP1Q12230 DEP1YAL013W 1218 nt16.5■□□□□ 0.23
LSP1Q12230 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.43■□□□□ 0.22
LSP1Q12230 OPI9YLR338W 858 nt16.41■□□□□ 0.22
LSP1Q12230 SCR1SCR1 522 nt16.29■□□□□ 0.2
LSP1Q12230 BSC6YOL137W 1494 nt16.27■□□□□ 0.19
LSP1Q12230 RPN10YHR200W 807 nt16.18■□□□□ 0.18
LSP1Q12230 YDJ1YNL064C 1230 nt16.17■□□□□ 0.18
LSP1Q12230 RRN5YLR141W 1092 nt16.1■□□□□ 0.17
LSP1Q12230 YNL208WYNL208W 600 nt16.07■□□□□ 0.16
LSP1Q12230 BUD23YCR047C 828 nt16.05■□□□□ 0.16
LSP1Q12230 GAR1YHR089C 618 nt15.99■□□□□ 0.15
LSP1Q12230 PUN1YLR414C 792 nt15.92■□□□□ 0.14
LSP1Q12230 PTC2YER089C 1395 nt15.88■□□□□ 0.13
LSP1Q12230 ATS1YAL020C 1002 nt15.88■□□□□ 0.13
LSP1Q12230 YJR018WYJR018W 363 nt15.78■□□□□ 0.12
LSP1Q12230 SPT5YML010W 3192 nt15.77■□□□□ 0.12
LSP1Q12230 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.76■□□□□ 0.11
LSP1Q12230 NAB2YGL122C 1578 nt15.7■□□□□ 0.1
LSP1Q12230 RSB1YOR049C 1065 nt15.64■□□□□ 0.09
LSP1Q12230 SSA4YER103W 1929 nt15.56■□□□□ 0.08
LSP1Q12230 FPR4YLR449W 1179 nt15.46■□□□□ 0.07
LSP1Q12230 TIR1YER011W 765 nt15.45■□□□□ 0.06
LSP1Q12230 FIS1YIL065C 468 nt15.43■□□□□ 0.06
LSP1Q12230 YJR120WYJR120W 351 nt15.4■□□□□ 0.06
LSP1Q12230 DAL1YIR027C 1383 nt15.39■□□□□ 0.05
LSP1Q12230 SSA1YAL005C 1929 nt15.37■□□□□ 0.05
LSP1Q12230 RPP2BYDR382W 333 nt15.31■□□□□ 0.04
LSP1Q12230 MEP2YNL142W 1500 nt15.29■□□□□ 0.04
LSP1Q12230 PHO4YFR034C 939 nt15.28■□□□□ 0.04
LSP1Q12230 INM2YDR287W 879 nt15.24■□□□□ 0.03
LSP1Q12230 YPS1YLR120C 1710 nt15.14■□□□□ 0.01
LSP1Q12230 DCW1YKL046C 1350 nt15.1■□□□□ 0.01
LSP1Q12230 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.08■□□□□ 0
LSP1Q12230 YBL100CYBL100C 315 nt15.06■□□□□ 0
LSP1Q12230 SRB2YHR041C 633 nt15.04■□□□□ -0
LSP1Q12230 YDR095CYDR095C 411 nt14.95□□□□□ -0.02
LSP1Q12230 BDF1YLR399C 2061 nt14.95□□□□□ -0.02
LSP1Q12230 BDH2YAL061W 1254 nt14.88□□□□□ -0.03
LSP1Q12230 EMI2YDR516C 1503 nt14.86□□□□□ -0.03
LSP1Q12230 FUN26YAL022C 1554 nt14.85□□□□□ -0.03
LSP1Q12230 ALF1YNL148C 765 nt14.79□□□□□ -0.04
LSP1Q12230 PST2YDR032C 597 nt14.78□□□□□ -0.04
LSP1Q12230 YMR090WYMR090W 684 nt14.78□□□□□ -0.04
LSP1Q12230 TAT1YBR069C 1860 nt14.75□□□□□ -0.05
LSP1Q12230 YBR220CYBR220C 1683 nt14.72□□□□□ -0.05
LSP1Q12230 TRM9YML014W 840 nt14.72□□□□□ -0.05
LSP1Q12230 WWM1YFL010C 636 nt14.71□□□□□ -0.05
LSP1Q12230 CAC2YML102W 1407 nt14.7□□□□□ -0.06
LSP1Q12230 RPP2AYOL039W 321 nt14.69□□□□□ -0.06
LSP1Q12230 YDL221WYDL221W 552 nt14.68□□□□□ -0.06
LSP1Q12230 PTP1YDL230W 1008 nt14.68□□□□□ -0.06
LSP1Q12230 SDH1YKL148C 1923 nt14.59□□□□□ -0.07
LSP1Q12230 CCT6YDR188W 1641 nt14.55□□□□□ -0.08
LSP1Q12230 LSM3YLR438C-A 270 nt14.54□□□□□ -0.08
LSP1Q12230 SIS1YNL007C 1059 nt14.5□□□□□ -0.09
LSP1Q12230 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.49□□□□□ -0.09
LSP1Q12230 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.49□□□□□ -0.09
LSP1Q12230 IRC15YPL017C 1500 nt14.46□□□□□ -0.1
LSP1Q12230 SCC4YER147C 1875 nt14.44□□□□□ -0.1
LSP1Q12230 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.41□□□□□ -0.1
LSP1Q12230 YGR021WYGR021W 873 nt14.39□□□□□ -0.11
LSP1Q12230 GIS3YLR094C 1509 nt14.39□□□□□ -0.11
LSP1Q12230 ART5YGR068C 1761 nt14.38□□□□□ -0.11
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