Protein–RNA interactions for Protein: Q07820

MCL1, Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCL1Q07820 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCL1Q07820 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCL1Q07820 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCL1Q07820 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCL1Q07820 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCL1Q07820 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCL1Q07820 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCL1Q07820 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCL1Q07820 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCL1Q07820 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCL1Q07820 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCL1Q07820 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCL1Q07820 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCL1Q07820 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCL1Q07820 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCL1Q07820 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCL1Q07820 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCL1Q07820 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCL1Q07820 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms