Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKCQQ04759 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCQQ04759 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCQQ04759 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCQQ04759 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCQQ04759 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCQQ04759 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCQQ04759 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCQQ04759 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCQQ04759 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCQQ04759 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCQQ04759 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCQQ04759 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCQQ04759 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCQQ04759 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCQQ04759 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCQQ04759 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCQQ04759 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCQQ04759 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms