Protein–RNA interactions for Protein: Q04726

TLE3, Transducin-like enhancer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE3Q04726 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLE3Q04726 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLE3Q04726 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLE3Q04726 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLE3Q04726 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLE3Q04726 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TLE3Q04726 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLE3Q04726 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms