Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALK2Q01415 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GALK2Q01415 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GALK2Q01415 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GALK2Q01415 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GALK2Q01415 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms