Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GALK2Q01415 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GALK2Q01415 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GALK2Q01415 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GALK2Q01415 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GALK2Q01415 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GALK2Q01415 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GALK2Q01415 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GALK2Q01415 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GALK2Q01415 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GALK2Q01415 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GALK2Q01415 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GALK2Q01415 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GALK2Q01415 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GALK2Q01415 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GALK2Q01415 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GALK2Q01415 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALK2Q01415 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALK2Q01415 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GALK2Q01415 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GALK2Q01415 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GALK2Q01415 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GALK2Q01415 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GALK2Q01415 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GALK2Q01415 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GALK2Q01415 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GALK2Q01415 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GALK2Q01415 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GALK2Q01415 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GALK2Q01415 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GALK2Q01415 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GALK2Q01415 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GALK2Q01415 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GALK2Q01415 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GALK2Q01415 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GALK2Q01415 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GALK2Q01415 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GALK2Q01415 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GALK2Q01415 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GALK2Q01415 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GALK2Q01415 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GALK2Q01415 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GALK2Q01415 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GALK2Q01415 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GALK2Q01415 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GALK2Q01415 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GALK2Q01415 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GALK2Q01415 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GALK2Q01415 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GALK2Q01415 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GALK2Q01415 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GALK2Q01415 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GALK2Q01415 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GALK2Q01415 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GALK2Q01415 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GALK2Q01415 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GALK2Q01415 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GALK2Q01415 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GALK2Q01415 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GALK2Q01415 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GALK2Q01415 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GALK2Q01415 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GALK2Q01415 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GALK2Q01415 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GALK2Q01415 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GALK2Q01415 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GALK2Q01415 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GALK2Q01415 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GALK2Q01415 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GALK2Q01415 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GALK2Q01415 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GALK2Q01415 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GALK2Q01415 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GALK2Q01415 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GALK2Q01415 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GALK2Q01415 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GALK2Q01415 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GALK2Q01415 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GALK2Q01415 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GALK2Q01415 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GALK2Q01415 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GALK2Q01415 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GALK2Q01415 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALK2Q01415 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GALK2Q01415 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GALK2Q01415 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GALK2Q01415 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GALK2Q01415 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GALK2Q01415 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GALK2Q01415 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALK2Q01415 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALK2Q01415 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GALK2Q01415 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GALK2Q01415 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GALK2Q01415 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GALK2Q01415 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GALK2Q01415 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALK2Q01415 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GALK2Q01415 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GALK2Q01415 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms