Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS29P62273 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS29P62273 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS29P62273 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS29P62273 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS29P62273 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS29P62273 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS29P62273 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPS29P62273 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPS29P62273 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPS29P62273 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPS29P62273 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPS29P62273 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPS29P62273 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPS29P62273 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPS29P62273 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPS29P62273 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS29P62273 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS29P62273 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS29P62273 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS29P62273 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS29P62273 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS29P62273 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS29P62273 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS29P62273 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS29P62273 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS29P62273 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS29P62273 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS29P62273 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS29P62273 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS29P62273 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS29P62273 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS29P62273 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS29P62273 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS29P62273 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS29P62273 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS29P62273 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS29P62273 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS29P62273 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS29P62273 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS29P62273 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS29P62273 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS29P62273 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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