Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP6P59044 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NLRP6P59044 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NLRP6P59044 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NLRP6P59044 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP6P59044 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NLRP6P59044 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NLRP6P59044 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NLRP6P59044 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NLRP6P59044 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NLRP6P59044 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
NLRP6P59044 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP6P59044 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NLRP6P59044 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP6P59044 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP6P59044 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NLRP6P59044 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NLRP6P59044 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NLRP6P59044 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP6P59044 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP6P59044 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP6P59044 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
NLRP6P59044 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NLRP6P59044 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NLRP6P59044 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms