Protein–RNA interactions for Protein: P58417

NXPH1, Neurexophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH1P58417 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NXPH1P58417 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NXPH1P58417 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NXPH1P58417 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXPH1P58417 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXPH1P58417 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NXPH1P58417 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NXPH1P58417 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NXPH1P58417 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NXPH1P58417 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXPH1P58417 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXPH1P58417 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXPH1P58417 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPH1P58417 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NXPH1P58417 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NXPH1P58417 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXPH1P58417 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NXPH1P58417 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPH1P58417 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXPH1P58417 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXPH1P58417 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms