Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SUCLG1P53597 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUCLG1P53597 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUCLG1P53597 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLG1P53597 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms