Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CCT4P50991 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCT4P50991 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCT4P50991 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCT4P50991 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCT4P50991 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCT4P50991 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCT4P50991 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCT4P50991 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCT4P50991 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCT4P50991 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCT4P50991 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCT4P50991 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCT4P50991 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCT4P50991 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCT4P50991 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CCT4P50991 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCT4P50991 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCT4P50991 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCT4P50991 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCT4P50991 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCT4P50991 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCT4P50991 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCT4P50991 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCT4P50991 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCT4P50991 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCT4P50991 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCT4P50991 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCT4P50991 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCT4P50991 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCT4P50991 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCT4P50991 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CCT4P50991 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCT4P50991 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCT4P50991 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCT4P50991 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCT4P50991 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCT4P50991 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCT4P50991 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCT4P50991 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCT4P50991 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCT4P50991 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCT4P50991 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCT4P50991 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCT4P50991 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCT4P50991 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCT4P50991 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCT4P50991 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCT4P50991 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCT4P50991 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCT4P50991 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCT4P50991 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCT4P50991 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCT4P50991 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCT4P50991 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCT4P50991 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCT4P50991 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCT4P50991 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCT4P50991 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCT4P50991 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCT4P50991 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCT4P50991 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CCT4P50991 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCT4P50991 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCT4P50991 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCT4P50991 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCT4P50991 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CCT4P50991 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCT4P50991 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCT4P50991 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCT4P50991 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCT4P50991 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCT4P50991 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCT4P50991 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCT4P50991 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCT4P50991 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCT4P50991 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCT4P50991 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCT4P50991 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCT4P50991 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCT4P50991 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCT4P50991 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCT4P50991 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCT4P50991 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCT4P50991 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCT4P50991 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCT4P50991 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCT4P50991 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCT4P50991 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCT4P50991 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCT4P50991 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CCT4P50991 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CCT4P50991 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCT4P50991 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCT4P50991 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCT4P50991 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCT4P50991 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCT4P50991 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCT4P50991 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCT4P50991 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms