Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB2P49721 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB2P49721 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB2P49721 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB2P49721 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB2P49721 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms