Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CSNK1DP48730 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSNK1DP48730 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSNK1DP48730 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSNK1DP48730 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSNK1DP48730 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSNK1DP48730 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms