Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSPA13P48723 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA13P48723 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPA13P48723 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA13P48723 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA13P48723 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPA13P48723 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPA13P48723 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms