Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPL21P46778 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPL21P46778 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RPL21P46778 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPL21P46778 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPL21P46778 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPL21P46778 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPL21P46778 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPL21P46778 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPL21P46778 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPL21P46778 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPL21P46778 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPL21P46778 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPL21P46778 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPL21P46778 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPL21P46778 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL21P46778 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL21P46778 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL21P46778 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL21P46778 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPL21P46778 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPL21P46778 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPL21P46778 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPL21P46778 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL21P46778 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL21P46778 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL21P46778 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL21P46778 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL21P46778 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL21P46778 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL21P46778 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL21P46778 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPL21P46778 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPL21P46778 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPL21P46778 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPL21P46778 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPL21P46778 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPL21P46778 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPL21P46778 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPL21P46778 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPL21P46778 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPL21P46778 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPL21P46778 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPL21P46778 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPL21P46778 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL21P46778 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL21P46778 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL21P46778 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL21P46778 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL21P46778 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL21P46778 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL21P46778 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPL21P46778 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPL21P46778 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPL21P46778 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPL21P46778 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPL21P46778 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPL21P46778 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPL21P46778 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPL21P46778 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPL21P46778 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPL21P46778 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RPL21P46778 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPL21P46778 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPL21P46778 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPL21P46778 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPL21P46778 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RPL21P46778 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPL21P46778 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPL21P46778 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPL21P46778 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPL21P46778 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPL21P46778 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPL21P46778 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPL21P46778 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPL21P46778 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPL21P46778 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPL21P46778 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RPL21P46778 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPL21P46778 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPL21P46778 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPL21P46778 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPL21P46778 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPL21P46778 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL21P46778 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL21P46778 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL21P46778 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL21P46778 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL21P46778 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL21P46778 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL21P46778 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPL21P46778 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPL21P46778 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL21P46778 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL21P46778 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL21P46778 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL21P46778 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL21P46778 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL21P46778 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL21P46778 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms