Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPRR1AP35321 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPRR1AP35321 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR1AP35321 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRR1AP35321 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms