Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RDXP35241 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RDXP35241 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RDXP35241 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RDXP35241 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RDXP35241 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RDXP35241 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RDXP35241 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDXP35241 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDXP35241 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDXP35241 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDXP35241 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RDXP35241 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDXP35241 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RDXP35241 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RDXP35241 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RDXP35241 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RDXP35241 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDXP35241 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDXP35241 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDXP35241 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDXP35241 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDXP35241 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RDXP35241 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RDXP35241 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RDXP35241 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RDXP35241 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RDXP35241 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RDXP35241 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RDXP35241 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RDXP35241 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RDXP35241 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RDXP35241 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RDXP35241 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RDXP35241 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RDXP35241 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RDXP35241 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RDXP35241 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RDXP35241 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RDXP35241 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RDXP35241 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RDXP35241 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RDXP35241 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RDXP35241 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RDXP35241 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RDXP35241 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RDXP35241 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RDXP35241 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RDXP35241 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RDXP35241 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RDXP35241 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RDXP35241 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RDXP35241 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RDXP35241 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RDXP35241 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RDXP35241 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RDXP35241 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RDXP35241 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RDXP35241 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RDXP35241 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RDXP35241 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RDXP35241 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RDXP35241 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RDXP35241 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RDXP35241 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RDXP35241 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RDXP35241 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RDXP35241 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RDXP35241 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RDXP35241 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RDXP35241 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RDXP35241 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RDXP35241 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RDXP35241 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RDXP35241 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RDXP35241 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RDXP35241 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RDXP35241 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RDXP35241 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RDXP35241 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RDXP35241 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RDXP35241 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDXP35241 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDXP35241 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDXP35241 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDXP35241 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDXP35241 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDXP35241 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RDXP35241 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RDXP35241 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RDXP35241 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RDXP35241 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RDXP35241 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RDXP35241 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RDXP35241 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RDXP35241 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RDXP35241 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RDXP35241 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RDXP35241 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RDXP35241 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms