Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA4P35212 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA4P35212 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA4P35212 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA4P35212 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA4P35212 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA4P35212 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA4P35212 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA4P35212 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA4P35212 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GJA4P35212 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA4P35212 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA4P35212 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA4P35212 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA4P35212 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJA4P35212 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA4P35212 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA4P35212 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA4P35212 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJA4P35212 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJA4P35212 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA4P35212 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJA4P35212 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA4P35212 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA4P35212 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA4P35212 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA4P35212 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA4P35212 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA4P35212 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA4P35212 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA4P35212 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA4P35212 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA4P35212 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA4P35212 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA4P35212 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA4P35212 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA4P35212 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA4P35212 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA4P35212 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJA4P35212 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA4P35212 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA4P35212 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA4P35212 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA4P35212 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA4P35212 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA4P35212 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA4P35212 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA4P35212 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA4P35212 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA4P35212 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA4P35212 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA4P35212 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA4P35212 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA4P35212 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA4P35212 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA4P35212 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA4P35212 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA4P35212 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA4P35212 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA4P35212 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA4P35212 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA4P35212 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA4P35212 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA4P35212 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA4P35212 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA4P35212 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA4P35212 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA4P35212 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA4P35212 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA4P35212 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA4P35212 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA4P35212 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA4P35212 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA4P35212 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA4P35212 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA4P35212 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA4P35212 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA4P35212 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA4P35212 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA4P35212 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA4P35212 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA4P35212 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA4P35212 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA4P35212 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA4P35212 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA4P35212 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA4P35212 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA4P35212 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA4P35212 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA4P35212 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA4P35212 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA4P35212 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA4P35212 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA4P35212 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA4P35212 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA4P35212 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA4P35212 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA4P35212 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA4P35212 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA4P35212 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms