Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX7P23759 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX7P23759 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX7P23759 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX7P23759 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX7P23759 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX7P23759 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX7P23759 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAX7P23759 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAX7P23759 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAX7P23759 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAX7P23759 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAX7P23759 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX7P23759 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX7P23759 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX7P23759 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX7P23759 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX7P23759 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX7P23759 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX7P23759 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX7P23759 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX7P23759 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX7P23759 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX7P23759 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAX7P23759 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAX7P23759 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAX7P23759 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX7P23759 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX7P23759 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX7P23759 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX7P23759 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX7P23759 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX7P23759 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX7P23759 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX7P23759 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX7P23759 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX7P23759 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX7P23759 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX7P23759 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX7P23759 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX7P23759 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAX7P23759 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAX7P23759 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAX7P23759 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAX7P23759 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAX7P23759 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAX7P23759 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAX7P23759 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX7P23759 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX7P23759 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX7P23759 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX7P23759 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX7P23759 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX7P23759 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAX7P23759 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX7P23759 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX7P23759 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX7P23759 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX7P23759 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX7P23759 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX7P23759 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX7P23759 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX7P23759 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX7P23759 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX7P23759 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX7P23759 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX7P23759 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX7P23759 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX7P23759 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX7P23759 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX7P23759 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX7P23759 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX7P23759 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX7P23759 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX7P23759 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX7P23759 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX7P23759 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX7P23759 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX7P23759 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAX7P23759 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAX7P23759 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX7P23759 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX7P23759 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX7P23759 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX7P23759 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAX7P23759 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PAX7P23759 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAX7P23759 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAX7P23759 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAX7P23759 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX7P23759 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX7P23759 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX7P23759 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX7P23759 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX7P23759 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX7P23759 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX7P23759 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX7P23759 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAX7P23759 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAX7P23759 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms