Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI3P19429 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3P19429 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3P19429 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI3P19429 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms