Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
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