Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP1P11387 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP1P11387 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP1P11387 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP1P11387 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP1P11387 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP1P11387 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP1P11387 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP1P11387 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP1P11387 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP1P11387 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP1P11387 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP1P11387 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP1P11387 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP1P11387 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP1P11387 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP1P11387 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP1P11387 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP1P11387 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP1P11387 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP1P11387 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
TOP1P11387 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP1P11387 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP1P11387 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP1P11387 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP1P11387 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP1P11387 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP1P11387 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP1P11387 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP1P11387 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP1P11387 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP1P11387 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP1P11387 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP1P11387 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP1P11387 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP1P11387 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP1P11387 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOP1P11387 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOP1P11387 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOP1P11387 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP1P11387 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP1P11387 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP1P11387 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP1P11387 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP1P11387 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP1P11387 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP1P11387 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP1P11387 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP1P11387 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP1P11387 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP1P11387 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP1P11387 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP1P11387 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP1P11387 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP1P11387 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP1P11387 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP1P11387 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP1P11387 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP1P11387 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP1P11387 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP1P11387 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP1P11387 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP1P11387 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP1P11387 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP1P11387 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOP1P11387 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP1P11387 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP1P11387 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP1P11387 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP1P11387 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP1P11387 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP1P11387 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP1P11387 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP1P11387 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP1P11387 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP1P11387 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP1P11387 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP1P11387 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP1P11387 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP1P11387 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP1P11387 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP1P11387 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP1P11387 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP1P11387 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP1P11387 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP1P11387 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP1P11387 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP1P11387 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP1P11387 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP1P11387 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP1P11387 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOP1P11387 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP1P11387 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP1P11387 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP1P11387 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TOP1P11387 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP1P11387 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP1P11387 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP1P11387 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOP1P11387 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms