Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PYGBP11216 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PYGBP11216 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PYGBP11216 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PYGBP11216 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PYGBP11216 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PYGBP11216 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PYGBP11216 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PYGBP11216 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PYGBP11216 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PYGBP11216 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PYGBP11216 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PYGBP11216 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PYGBP11216 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PYGBP11216 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PYGBP11216 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PYGBP11216 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PYGBP11216 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PYGBP11216 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PYGBP11216 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PYGBP11216 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PYGBP11216 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PYGBP11216 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PYGBP11216 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PYGBP11216 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PYGBP11216 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PYGBP11216 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PYGBP11216 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PYGBP11216 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PYGBP11216 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PYGBP11216 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PYGBP11216 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PYGBP11216 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PYGBP11216 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PYGBP11216 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PYGBP11216 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PYGBP11216 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PYGBP11216 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PYGBP11216 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PYGBP11216 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PYGBP11216 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PYGBP11216 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PYGBP11216 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PYGBP11216 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PYGBP11216 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PYGBP11216 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PYGBP11216 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PYGBP11216 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PYGBP11216 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PYGBP11216 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PYGBP11216 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PYGBP11216 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PYGBP11216 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PYGBP11216 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PYGBP11216 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PYGBP11216 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PYGBP11216 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PYGBP11216 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PYGBP11216 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PYGBP11216 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PYGBP11216 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PYGBP11216 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PYGBP11216 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PYGBP11216 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PYGBP11216 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PYGBP11216 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PYGBP11216 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PYGBP11216 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PYGBP11216 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PYGBP11216 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PYGBP11216 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PYGBP11216 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PYGBP11216 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PYGBP11216 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PYGBP11216 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PYGBP11216 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PYGBP11216 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PYGBP11216 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PYGBP11216 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PYGBP11216 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PYGBP11216 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PYGBP11216 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PYGBP11216 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PYGBP11216 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PYGBP11216 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYGBP11216 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYGBP11216 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYGBP11216 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYGBP11216 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYGBP11216 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYGBP11216 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYGBP11216 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYGBP11216 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYGBP11216 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYGBP11216 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PYGBP11216 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PYGBP11216 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PYGBP11216 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PYGBP11216 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PYGBP11216 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms