Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HSP90AB1P08238 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HSP90AB1P08238 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HSP90AB1P08238 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HSP90AB1P08238 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HSP90AB1P08238 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HSP90AB1P08238 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HSP90AB1P08238 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
HSP90AB1P08238 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HSP90AB1P08238 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HSP90AB1P08238 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HSP90AB1P08238 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms