Protein–RNA interactions for Protein: P07478

PRSS2, Trypsin-2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS2P07478 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRSS2P07478 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRSS2P07478 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRSS2P07478 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRSS2P07478 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms