Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV4-1P06312 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV4-1P06312 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV4-1P06312 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV4-1P06312 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms