Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSPAN13O95857 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSPAN13O95857 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPAN13O95857 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSPAN13O95857 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPAN13O95857 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms