Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB5O95377 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJB5O95377 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJB5O95377 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJB5O95377 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB5O95377 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB5O95377 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB5O95377 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB5O95377 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB5O95377 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB5O95377 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB5O95377 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB5O95377 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB5O95377 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB5O95377 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB5O95377 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB5O95377 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB5O95377 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB5O95377 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB5O95377 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB5O95377 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB5O95377 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJB5O95377 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJB5O95377 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GJB5O95377 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJB5O95377 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJB5O95377 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB5O95377 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB5O95377 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB5O95377 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB5O95377 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB5O95377 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB5O95377 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJB5O95377 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJB5O95377 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJB5O95377 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJB5O95377 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB5O95377 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB5O95377 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJB5O95377 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJB5O95377 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJB5O95377 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB5O95377 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB5O95377 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB5O95377 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB5O95377 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB5O95377 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB5O95377 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB5O95377 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB5O95377 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB5O95377 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB5O95377 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB5O95377 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB5O95377 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB5O95377 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJB5O95377 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJB5O95377 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJB5O95377 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJB5O95377 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB5O95377 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB5O95377 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB5O95377 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB5O95377 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB5O95377 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GJB5O95377 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJB5O95377 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB5O95377 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB5O95377 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB5O95377 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJB5O95377 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJB5O95377 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB5O95377 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB5O95377 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJB5O95377 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB5O95377 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB5O95377 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB5O95377 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB5O95377 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB5O95377 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB5O95377 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB5O95377 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB5O95377 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB5O95377 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB5O95377 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB5O95377 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB5O95377 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB5O95377 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB5O95377 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB5O95377 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms