Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CSPG5O95196 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSPG5O95196 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSPG5O95196 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSPG5O95196 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CSPG5O95196 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSPG5O95196 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSPG5O95196 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms