Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX30O94993 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX30O94993 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX30O94993 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX30O94993 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX30O94993 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX30O94993 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX30O94993 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX30O94993 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX30O94993 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX30O94993 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX30O94993 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX30O94993 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX30O94993 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX30O94993 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX30O94993 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX30O94993 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX30O94993 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX30O94993 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX30O94993 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX30O94993 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX30O94993 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX30O94993 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX30O94993 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX30O94993 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX30O94993 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX30O94993 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX30O94993 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX30O94993 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX30O94993 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX30O94993 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX30O94993 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX30O94993 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX30O94993 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX30O94993 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX30O94993 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX30O94993 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX30O94993 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOX30O94993 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX30O94993 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX30O94993 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX30O94993 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX30O94993 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX30O94993 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX30O94993 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX30O94993 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX30O94993 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX30O94993 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX30O94993 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX30O94993 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX30O94993 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX30O94993 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX30O94993 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX30O94993 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX30O94993 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX30O94993 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX30O94993 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX30O94993 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX30O94993 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX30O94993 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX30O94993 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX30O94993 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX30O94993 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX30O94993 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX30O94993 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX30O94993 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX30O94993 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX30O94993 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX30O94993 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX30O94993 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX30O94993 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX30O94993 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX30O94993 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOX30O94993 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX30O94993 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX30O94993 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX30O94993 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX30O94993 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX30O94993 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX30O94993 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX30O94993 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX30O94993 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX30O94993 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX30O94993 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX30O94993 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX30O94993 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX30O94993 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX30O94993 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX30O94993 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX30O94993 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX30O94993 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX30O94993 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX30O94993 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX30O94993 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX30O94993 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX30O94993 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX30O94993 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX30O94993 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX30O94993 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX30O94993 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms