Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL18O94889 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL18O94889 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL18O94889 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL18O94889 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL18O94889 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL18O94889 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms