Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KLHL18O94889 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KLHL18O94889 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
KLHL18O94889 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KLHL18O94889 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KLHL18O94889 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KLHL18O94889 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KLHL18O94889 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KLHL18O94889 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KLHL18O94889 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KLHL18O94889 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHL18O94889 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KLHL18O94889 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KLHL18O94889 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KLHL18O94889 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KLHL18O94889 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KLHL18O94889 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KLHL18O94889 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KLHL18O94889 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KLHL18O94889 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHL18O94889 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHL18O94889 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHL18O94889 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KLHL18O94889 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KLHL18O94889 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KLHL18O94889 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KLHL18O94889 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KLHL18O94889 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KLHL18O94889 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL18O94889 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KLHL18O94889 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHL18O94889 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL18O94889 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHL18O94889 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KLHL18O94889 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHL18O94889 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHL18O94889 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KLHL18O94889 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KLHL18O94889 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KLHL18O94889 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KLHL18O94889 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KLHL18O94889 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL18O94889 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KLHL18O94889 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KLHL18O94889 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHL18O94889 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHL18O94889 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHL18O94889 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHL18O94889 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL18O94889 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL18O94889 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHL18O94889 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHL18O94889 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHL18O94889 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHL18O94889 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KLHL18O94889 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHL18O94889 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHL18O94889 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHL18O94889 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHL18O94889 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHL18O94889 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHL18O94889 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHL18O94889 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHL18O94889 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL18O94889 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHL18O94889 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHL18O94889 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL18O94889 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHL18O94889 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHL18O94889 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHL18O94889 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL18O94889 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL18O94889 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHL18O94889 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHL18O94889 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL18O94889 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL18O94889 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL18O94889 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHL18O94889 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL18O94889 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL18O94889 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL18O94889 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL18O94889 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL18O94889 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL18O94889 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL18O94889 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL18O94889 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHL18O94889 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL18O94889 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL18O94889 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL18O94889 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL18O94889 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL18O94889 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL18O94889 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL18O94889 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL18O94889 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL18O94889 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL18O94889 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL18O94889 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL18O94889 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms