Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MSCO60682 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MSCO60682 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MSCO60682 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MSCO60682 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MSCO60682 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
MSCO60682 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MSCO60682 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MSCO60682 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MSCO60682 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MSCO60682 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MSCO60682 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MSCO60682 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MSCO60682 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MSCO60682 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
MSCO60682 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MSCO60682 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MSCO60682 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MSCO60682 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MSCO60682 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MSCO60682 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MSCO60682 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MSCO60682 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MSCO60682 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MSCO60682 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MSCO60682 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MSCO60682 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MSCO60682 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MSCO60682 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
MSCO60682 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
MSCO60682 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
MSCO60682 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MSCO60682 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MSCO60682 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MSCO60682 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MSCO60682 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MSCO60682 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MSCO60682 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MSCO60682 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MSCO60682 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
MSCO60682 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MSCO60682 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MSCO60682 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MSCO60682 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MSCO60682 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MSCO60682 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MSCO60682 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MSCO60682 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MSCO60682 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MSCO60682 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MSCO60682 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MSCO60682 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MSCO60682 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MSCO60682 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MSCO60682 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MSCO60682 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MSCO60682 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MSCO60682 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MSCO60682 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MSCO60682 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MSCO60682 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MSCO60682 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MSCO60682 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MSCO60682 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MSCO60682 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MSCO60682 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MSCO60682 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MSCO60682 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MSCO60682 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MSCO60682 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MSCO60682 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MSCO60682 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
MSCO60682 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MSCO60682 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MSCO60682 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MSCO60682 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MSCO60682 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MSCO60682 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MSCO60682 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MSCO60682 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MSCO60682 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MSCO60682 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MSCO60682 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MSCO60682 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MSCO60682 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MSCO60682 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MSCO60682 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MSCO60682 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MSCO60682 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MSCO60682 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSCO60682 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSCO60682 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSCO60682 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSCO60682 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSCO60682 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSCO60682 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSCO60682 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSCO60682 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSCO60682 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms