Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PPLO60437 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PPLO60437 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PPLO60437 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PPLO60437 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PPLO60437 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PPLO60437 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PPLO60437 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PPLO60437 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
PPLO60437 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PPLO60437 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PPLO60437 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PPLO60437 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PPLO60437 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PPLO60437 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PPLO60437 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
PPLO60437 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PPLO60437 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PPLO60437 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PPLO60437 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PPLO60437 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PPLO60437 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PPLO60437 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PPLO60437 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PPLO60437 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
PPLO60437 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PPLO60437 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PPLO60437 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PPLO60437 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PPLO60437 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PPLO60437 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PPLO60437 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PPLO60437 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PPLO60437 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PPLO60437 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PPLO60437 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PPLO60437 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PPLO60437 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PPLO60437 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PPLO60437 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PPLO60437 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PPLO60437 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PPLO60437 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PPLO60437 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PPLO60437 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PPLO60437 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PPLO60437 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PPLO60437 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PPLO60437 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PPLO60437 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PPLO60437 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PPLO60437 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PPLO60437 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PPLO60437 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PPLO60437 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PPLO60437 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
PPLO60437 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PPLO60437 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PPLO60437 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PPLO60437 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PPLO60437 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PPLO60437 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PPLO60437 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PPLO60437 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PPLO60437 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PPLO60437 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PPLO60437 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PPLO60437 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PPLO60437 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PPLO60437 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
PPLO60437 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
PPLO60437 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
PPLO60437 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PPLO60437 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PPLO60437 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PPLO60437 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PPLO60437 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PPLO60437 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PPLO60437 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PPLO60437 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PPLO60437 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PPLO60437 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
PPLO60437 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
PPLO60437 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
PPLO60437 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
PPLO60437 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PPLO60437 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PPLO60437 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPLO60437 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPLO60437 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPLO60437 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPLO60437 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPLO60437 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPLO60437 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PPLO60437 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PPLO60437 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PPLO60437 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PPLO60437 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PPLO60437 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PPLO60437 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms