Protein–RNA interactions for Protein: O43361

ZNF749, Zinc finger protein 749, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF749O43361 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF749O43361 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF749O43361 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF749O43361 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF749O43361 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF749O43361 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms