Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC7A4O43246 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC7A4O43246 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC7A4O43246 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC7A4O43246 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC7A4O43246 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A4O43246 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms