Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZZEF1O43149 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZZEF1O43149 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZZEF1O43149 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZZEF1O43149 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZZEF1O43149 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZZEF1O43149 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZZEF1O43149 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZZEF1O43149 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZZEF1O43149 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZZEF1O43149 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZZEF1O43149 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZZEF1O43149 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZZEF1O43149 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZZEF1O43149 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZZEF1O43149 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZZEF1O43149 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZZEF1O43149 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms