Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC3O15234 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC3O15234 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC3O15234 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CASC3O15234 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC3O15234 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC3O15234 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC3O15234 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC3O15234 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC3O15234 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC3O15234 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC3O15234 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC3O15234 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC3O15234 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC3O15234 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC3O15234 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC3O15234 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC3O15234 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC3O15234 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC3O15234 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC3O15234 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC3O15234 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC3O15234 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC3O15234 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CASC3O15234 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASC3O15234 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC3O15234 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC3O15234 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC3O15234 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC3O15234 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC3O15234 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC3O15234 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC3O15234 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC3O15234 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC3O15234 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC3O15234 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC3O15234 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC3O15234 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC3O15234 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC3O15234 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC3O15234 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC3O15234 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASC3O15234 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASC3O15234 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASC3O15234 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASC3O15234 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASC3O15234 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASC3O15234 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASC3O15234 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC3O15234 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC3O15234 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC3O15234 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC3O15234 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASC3O15234 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASC3O15234 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASC3O15234 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC3O15234 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC3O15234 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC3O15234 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC3O15234 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC3O15234 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASC3O15234 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASC3O15234 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASC3O15234 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASC3O15234 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CASC3O15234 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASC3O15234 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASC3O15234 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASC3O15234 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASC3O15234 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASC3O15234 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASC3O15234 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASC3O15234 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASC3O15234 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASC3O15234 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASC3O15234 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASC3O15234 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASC3O15234 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASC3O15234 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CASC3O15234 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC3O15234 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC3O15234 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC3O15234 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC3O15234 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC3O15234 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC3O15234 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC3O15234 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC3O15234 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC3O15234 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC3O15234 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC3O15234 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC3O15234 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC3O15234 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC3O15234 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC3O15234 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC3O15234 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC3O15234 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC3O15234 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC3O15234 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC3O15234 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms