Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAMP3O14828 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAMP3O14828 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAMP3O14828 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAMP3O14828 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAMP3O14828 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAMP3O14828 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAMP3O14828 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAMP3O14828 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAMP3O14828 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAMP3O14828 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAMP3O14828 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAMP3O14828 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAMP3O14828 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAMP3O14828 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAMP3O14828 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAMP3O14828 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAMP3O14828 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAMP3O14828 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAMP3O14828 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAMP3O14828 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAMP3O14828 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCAMP3O14828 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAMP3O14828 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAMP3O14828 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAMP3O14828 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAMP3O14828 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAMP3O14828 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAMP3O14828 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAMP3O14828 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAMP3O14828 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAMP3O14828 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAMP3O14828 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAMP3O14828 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms