Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D7A6NKC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D7A6NKC9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH2D7A6NKC9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH2D7A6NKC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH2D7A6NKC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms