Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRBA1A5PL33 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRBA1A5PL33 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRBA1A5PL33 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRBA1A5PL33 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRBA1A5PL33 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRBA1A5PL33 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms