Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RRA0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RRA0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0U1RRA0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A0A0U1RRA0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms