Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQK1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQK1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQK1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQK1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQK1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQK1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0U1RQK1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms