Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN7L3BQ96GX2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN7L3BQ96GX2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms