Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms