Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms