Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD3Q9Y3P4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms